1. 十级质谱的能力
由于传统的离子阱在进行多级质谱的时候发生明显的信号衰减，通常只能做三到四级质谱。而LCMS-IT-TOF的离子阱则进行了独特的设计，有效的抑制了进行多级质谱时信号的衰减，实现了比传统离子阱更好的多级质谱能力。可以达到十级质谱的分析能力。

2．每级的MSn都能保证高质量精确度
LCMS-IT-TOF是世界上唯一的一台能保证每级MS的高质量精确度的质谱仪器，这对传统的Q-TOF和离子阱质谱来说完全是不可能的。

3．每级的MSn质谱图都能同时做到高分辨率、高质量精确度和高灵敏度
能同时获得高分辨率和高质量精确度MS, MS/MS, MS/MS/MS 。。。MSn的数据，所有这些模式都采用唯一的DSR（二级反射器）和BIE（弹道学离子提取技术）专利。并且能够利用CCI技术尽可能地捕集到经LC洗脱的全部色谱峰(经压缩的离子注入方式，日本专利No. 03386048).

4．极好的质量稳定性
整个仪器配备了完全的内部温度控制功能（包括飞行管），从而确保高稳定性的离子飞行距离和离子加速电压（这些都是影响质量稳定性的原因）。这就意味着更多级的MS分析中可以获得非常好的质量稳定性。同一批样品只要较一次标样就可以连续工作一周，质量精度可以保持在5ppm以内，而这种能力在其他TOF类型的仪器是很难实现的。

5. 高速切换于正离子模式和负离子模式之间
在一个样品的进样过程中，可以同时获得正离子模式和负离子模式的信息。只需要0.1秒就可以完成MS1的正离子模式和负离子模式的自动切换并扫描，并可以进行MSn的正离子模式和负离子模式的相互之间切换并扫描。特别是对于未知物的结构鉴定，执行正离子模式和负离子模式可以获得更可靠的质谱分析结果。尽管相互切换地时间很短，但正离子模式和负离子模式下的高质量准确度是仍然可以确保的。

6. 自动地MS/MS分析功能，在测定过程中可以自动切换从MS 到MSn的测定
在MS/MS 测定中，需要进行母离子的选择和从碎片离子中再选择母离子。这台仪器可以根据特定的参数设定情况自动选择母离子和从碎片离子中再选择母离子。对于未知物的检测，万一预先不知道母离子的质量数，母离子可以自动地执行MS/MS功能，从而可以进行有效的分析。

7. 配备了自动调谐功能.
仪器配备了自动的校正功能进行MS运转情况的校正，并进行MS轴的最优化校正。复杂地MS仪器的操作参数包括MS相关的部分，都能进行复杂地自动操作使之最优化。

8. 功能强大的分子式预测软件Formula Predictor
可以根据精确质量数鉴定和多级质谱信息进行准确快速的分子式预测，与其他仪器同类软件相比，Formula Predictor充分利于了多级质谱信息，使结构鉴定准确性达到了前所未有的水平。

9．蛋白鉴定软件ProteinLayer
该软件可以和仪器的操作软件无缝连接，如果与蛋白鉴定数据库联用，只需一次点击鼠标，就可以完成数据采集，数据后处理，多肽质谱峰的选取，数据库检索，蛋白鉴定，高度的自动化适用于高通量蛋白质组学研究。

10．代谢物鉴定软件MetID
岛津的代谢物鉴定软件充分利用了LMCS-IT-TOF的高质量精度多级质谱能力，可以有效的进行药物代谢物的精确分析，揭示复杂药物代谢的途径。MetID不仅实现了药物和代谢物的一级质谱谱图高质量精度的比对，初步筛选出可能的药物代谢途径；更实现了药物和代谢物二级质谱谱图的比对，进一步确认药物的碎片离子和代谢物的碎片离子的对比和匹配，从而准确的进行